在清洗檢測器前，需仔細閱讀所用氣相色譜對應的說明書，以確保不會造成檢測器損壞：

　　①當噴嘴只是輕微被污染時，可以略微加大載氣流量，同時增大檢測器的溫度，點火后，走基線，此時不要進樣。因為FID檢測器所檢測的對象，大多為有機化合物，噴嘴上的殘留以有機物為主，有機物可以通過燃燒生成水（氣態）和二氧化碳（氣體）被趕走。

　　② 若噴嘴污染較嚴重，但還未完全堵住時，可以用專用工具小心拆下，置于預先盛有乙醇或丙酮的玻璃燒杯中（溶劑需浸沒噴嘴），于超聲波中超聲清洗。

　　如果超聲清洗后還不行，可以用通針小心插入噴嘴孔中，輕輕抽拉，再用洗耳球將乙醇或丙酮從噴嘴的底座擠進去，讓溶劑從噴嘴噴出（這會形成一定的壓力，可以將噴嘴孔壁的附著物清除）。然后，再次重復上述超聲波清洗操作，用超聲波清洗。

　　③當噴嘴表面積碳（一層黑色物質），這也會影響靈敏度。可用細砂紙輕輕打磨表面除去。然后按照上述②的方法將噴嘴進行清洗。

　　④如果檢測器是因為積水造成的污染，先升高檢測器的溫度，運行一段時間，看能否恢復正常；如果積水過多，則需要將檢測器拆下，先用脫脂棉擦干，然后按照上述②的方法將檢測器處理一邊即可恢復使用。

　　⑤清洗后的各部件，要用鑷子取，勿用手摸。烘干后裝配時也要小心，否則會再度沾污。裝入儀器后，先通載氣半小時，再點火升高檢測室溫度，先在120℃保持幾小時之后，再升至工作溫度。