安全使用離心機，首先必須正確安裝好離心機，其次裝樣找平衡、鋁合金不能受腐蝕、清理離心腔內的積水、避免斷軸事故發生。下面進行詳細介紹。
　　離心機正確安裝：
　　1.電源電壓:
　　電壓波動要符合+10%以內的國家標準，否則一些廠家的離心機是不能正常運轉。如果電壓波動在此以上，建議用穩壓器，以供符合此電網。
　　2.地線要牢:
　　房間的電源的布線要符合要求。我國是三相四線制。三相是工業電中的三相，使用三相電時零線與地線分開，更重要的是不管是三相工業電也好，一般的單相電也好，地線應可靠，以免漏電，地線不能接在暖氣管、自來水管上。
　　3.地面要平整、牢固:
　　對大型離心機而言，在安裝地點搬動地板要牢固，保證離心機的轉子正常工作，不陷凹進去，安裝固定處地面應平整且牢固。
　　4.找好水平:
　　找較準確的小型水平尺，離心機蓋子打開，在主軸上找水平，通過調整4個腳輪旁邊的調整螺栓的擰動來找好水平，注意其中1腳不能落空。
　　離心機裝樣應找平衡：
　　離心機在設計與制造時，對轉子的加工誤差帶來的不平衡，已作了動平衡試驗的補救，但凡是離心機，都有其允許的裝樣不平衡量。離心機廠商為了在離心機允許的不平衡限量這一指標上與其他廠家競爭，盡量給出較大值。在這較大值上，離心機可以運轉，但這時產生的不平衡力以每分鐘n次頻率猛然沖擊軸承及支架，離心機是受損傷的。因此，用戶對那些昂貴的離心機，盡量找好平衡后離心，對離心機的壽命有好處。
　　常清理離心腔內的積水：
　　離心機運轉時使用制冷，由于空氣的水分，在離心腔內結霜，停機后霜化為水。大部分國外的低速大容量離心機，沒有排水孔，離心腔中水愈積愈多。此時，用戶應自行拆下轉子，清理積水。在重新安裝轉子時，一定要裝好，避免出事故。
　　鋁合金不受腐蝕：
　　離心機轉子一般是用鋁合金制造，當受腐蝕后強度降低，容易出事故。鋁合金易受液體腐蝕，清洗后應用吹風機吹干，或倒置一段時間，確認干了才能使用。有的血站進口離心機，6個鋁杯里應有的6個塑料托沒有。塑料托中應放血袋，避免直接放在鋁杯里。注意試管有無裂紋。若試管(尤其是反復使用的試管)有裂紋，萬萬不可使用，否則在使用中試管破裂會引起轉子旋轉中失去平衡，可引發斷軸等惡性事故。
　　斷軸事故：
　　轉子沒安放好，或裝樣品不平衡超過量太大，離心機開動。現代的進口離心機雖都有不平衡保護，即當不平衡量超過某一限時，應自動斷電，令離心機停轉。但在上述情況下，已經晚了，會出現惡性事故。惡性事故之一是斷軸，由于高速旋轉中突然斷軸，離心轉子沒有了支撐，在離心腔中亂轉亂撞，可使離心機整機轉270°角度。此時，若旁邊有人員或設備，會造成人員傷亡與毀壞設備的事故。