1、生物安全柜緩慢移動原則：為了避免影響正常的風路狀態(tài)，柜內(nèi)操作時手應(yīng)該盡量平緩移動。
　　2、生物安全柜物品平行擺放原則：為了避免物品和物品之間的交叉污染現(xiàn)象產(chǎn)生，在柜內(nèi)擺放的物品應(yīng)該盡量呈橫向一字擺開，避免回風過程中造成交叉污染。同時避免堵塞背部回風隔柵影響正常風路。
　　3、生物安全柜避免震動原則：柜內(nèi)盡量避免震動儀器（例如離心機、旋渦振蕩器等）的使用，因為震動會使得積留在濾膜上的顆粒物質(zhì)抖落，導(dǎo)致操作室內(nèi)部潔凈度降低，同時如果在前操作面平衡失敗還會引起安全柜對操作者的污染。
　　4、生物安全柜不同樣品柜內(nèi)移動原則：柜內(nèi)兩種及以上物品需要移動時，一定遵循低污染性物品向高污染性物品移動原則。
　　5、生物安全柜明火使用原則：柜內(nèi)盡量不要使用明火。因為在明火使用過程中產(chǎn)生的細小顆粒雜質(zhì)將被帶入濾膜區(qū)域，這些高溫雜質(zhì)會損傷濾膜。